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FPGA+深度學(xué)習(xí)技術(shù) 助力智慧醫(yī)療

在醫(yī)改大政策風(fēng)向標(biāo)的背后,是資本逐鹿試水,商業(yè)試錯?;ヂ?lián)網(wǎng)+醫(yī)療成為構(gòu)建新時代下智慧醫(yī)療的生態(tài)圈。但是,醫(yī)療信息化就等于真正的智慧醫(yī)療嗎?或者說只是智慧醫(yī)療的基礎(chǔ)?若論更加務(wù)實的智慧醫(yī)療則是在信息化基礎(chǔ)上的幫助診療,本文主要論述了FPGA+深度學(xué)習(xí)技術(shù)如何助力智慧醫(yī)療落地。

  醫(yī)療信息化≠真正智慧醫(yī)療

  “十三五”強(qiáng)調(diào)要促進(jìn)健康中國的建設(shè),其中智慧醫(yī)療被提上日程,智慧醫(yī)療成為深化醫(yī)改、推進(jìn)健康中國建設(shè)的重要技術(shù)手段。智慧醫(yī)療在百度的解釋是通過打造健康檔案區(qū)域醫(yī)療信息平臺,利用最先進(jìn)的物聯(lián)網(wǎng)技術(shù),實現(xiàn)患者與醫(yī)務(wù)人員、醫(yī)療機(jī)構(gòu)、醫(yī)療設(shè)備之間的互動,逐步達(dá)到信息化。作為建設(shè)智慧城市的一部分,智慧醫(yī)療對緩解看病難這一社會問題具有積極的推動作用,但是,如果把智慧醫(yī)療僅僅定義為醫(yī)療信息化,未免有些狹隘。

  不可置否,目前醫(yī)療產(chǎn)業(yè)面臨的大醫(yī)院人滿為患,社區(qū)醫(yī)院無人問津,病人就診手續(xù)繁瑣、看病難等等問題,都是由于醫(yī)療信息不暢,醫(yī)療資源兩極化等原因?qū)е碌?。近年來,醫(yī)療改革在醫(yī)療信息化的浪潮中取得了巨大成就,可以使患者用較短的等療時間、支付基本的醫(yī)療費用,就可以享受安全、便利、優(yōu)質(zhì)的診療服務(wù)。比如目前部分醫(yī)院支持在線預(yù)約專家、微信掛號及在線支付等功能,以及未來電子病歷及健康檔案的落地,可以減少了病人的等診時間及削減看病成本,但這并不是智慧醫(yī)療的全部。

  幫助診療也是智慧醫(yī)療的重要部分。杭州健培科技有限公司CEO程國華表示,目前國內(nèi)智慧醫(yī)療看到的只是醫(yī)療信息化這一基礎(chǔ)層面。針對一個醫(yī)院的信息化,軟件工程師基本可以全部搞定,但是真正做到智慧醫(yī)療,僅僅做醫(yī)療信息化是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的,智慧醫(yī)療最重要的是洞察大量非結(jié)構(gòu)化大數(shù)據(jù)背后的價值,以幫助醫(yī)生在最短的時間內(nèi)做出最精確的診斷。

  在幫助診療方面,目前國內(nèi)僅局限于不到10%的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的利用,而對于大量的非結(jié)構(gòu)化醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)缺乏認(rèn)知分析。由海歸博士團(tuán)隊聯(lián)手成立的杭州健培科技有限公司,從2014年開始與國內(nèi)外著名的研究機(jī)構(gòu)和高等院校展開合作,致力于醫(yī)學(xué)影像大數(shù)據(jù)分析技術(shù)(MIBA)的研發(fā)及應(yīng)用,并通過深度學(xué)習(xí)技術(shù),建立人工智能診斷系統(tǒng),幫助醫(yī)生診斷各種疾病,推動我國醫(yī)療創(chuàng)新領(lǐng)域理念從“方便診療”走向“幫助診療”,以此改變我國醫(yī)療衛(wèi)生資源分配不平衡、看病難、看病貴等問題。

  深度學(xué)習(xí)技術(shù)與疾病診斷

  當(dāng)下“互聯(lián)網(wǎng)+”推動了醫(yī)療行業(yè)大數(shù)據(jù)爆炸,據(jù)權(quán)威調(diào)查數(shù)據(jù)顯示,醫(yī)療行業(yè)非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)占整個數(shù)據(jù)量的90%左右,醫(yī)療行業(yè)的非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)主要包括醫(yī)療PACS系統(tǒng)產(chǎn)生的醫(yī)學(xué)影像,比如DR,CR,MRI等,如果能夠深挖這些海量影像數(shù)據(jù)背后的價值,將對精準(zhǔn)醫(yī)療研究、個體化治療、疾病治療與療效評價、重大疾病的風(fēng)險評估等具有重要的意義。目前,通過深度學(xué)習(xí)技術(shù),可以解讀醫(yī)療影像數(shù)據(jù),這在國外已經(jīng)有不少落地性案例,比如,今年倫敦帝國理工大學(xué)就宣布運用深度學(xué)習(xí)技術(shù)為基礎(chǔ)的腦部影像圖像分析工具,以協(xié)助醫(yī)生診斷大腦出現(xiàn)的損傷情況。但目前國內(nèi)在醫(yī)學(xué)圖像分析領(lǐng)域的應(yīng)用案例還是一片空白。

  對此,健培科技在國內(nèi)率先利用自主研發(fā)的“兩朵云”產(chǎn)品進(jìn)入醫(yī)療影像分析領(lǐng)域,即HealthView駐地云和HealthView診斷云。HealthView駐地云能有效的對醫(yī)院的非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)存儲系統(tǒng)整合和優(yōu)化配置,進(jìn)而為診斷云提供了數(shù)據(jù)倉庫。而診斷云側(cè)重于非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的分析和挖掘,將影像數(shù)據(jù)的重要臨床實用價值發(fā)揮出來。比如長久困擾放射科的肺癌早期和乳腺癌早期篩查誤診率居高不下的問題,通過計算機(jī)智能診斷的精確性,能夠極大的降低人為閱片的誤診率,通過計算機(jī)的高性能和不間斷運行,也能有效減輕放射科醫(yī)生的工作負(fù)荷,從而改善整個放射科的工作效率和質(zhì)量,最終提升患者就醫(yī)體驗。

  從技術(shù)創(chuàng)新角度而言,程國華說,“傳統(tǒng)的基于Hadoop的大數(shù)據(jù)處理平臺,有很多弊端,而且性價比也不高。隨著醫(yī)院云平臺需求的深入,原來的架構(gòu)已不能承載。目前Spark架構(gòu)是最先進(jìn)的,雖然Spark概念已提出幾年,但是在醫(yī)療行業(yè)的應(yīng)用還是全新的。對于醫(yī)療影像大數(shù)據(jù)應(yīng)用來講,它不僅能將性能提升至幾十倍甚至上百倍,同時可以降低存儲需求。”基于Spark架構(gòu)的駐地云可以幫助醫(yī)院進(jìn)行存儲、分享及傳輸醫(yī)療影像數(shù)據(jù),還可以進(jìn)行即時的交互,在此基礎(chǔ)上嫁接診斷云,整個醫(yī)院將變成智能化。

  HealthView診斷云在駐地云的基礎(chǔ)上,結(jié)合最新人工智能算法,實現(xiàn)海量相似病例檢索和醫(yī)學(xué)影像智能診斷,極大地幫助醫(yī)生進(jìn)行定位病癥、分析病情和指導(dǎo)手術(shù),屬于“臨床決策系統(tǒng)”的一部分,也是醫(yī)學(xué)科技發(fā)展的前沿方向。利用深度學(xué)習(xí)技術(shù)結(jié)合云計算平臺對醫(yī)學(xué)影像做分析,可以大大提高醫(yī)生的診斷率。據(jù)了解,放射科醫(yī)生診斷效率可以從原先的半小時一個病人到1分鐘一個病人,精準(zhǔn)度從70%到85%到90%的一個逐一變化來提高整個醫(yī)院的診斷效率與準(zhǔn)確度。這種幫助診療在一定程度上大大縮短了病人的等療時間,而且可以得到最精確的診斷。

  目前由健培科技聯(lián)合建立的研發(fā)實驗室,首先是通過對肺部影像分析來診斷各種疾病,程國華表示,醫(yī)生根據(jù)傳統(tǒng)的醫(yī)療影像,雖然可以判定疾病類型,但是由于肺部形狀不規(guī)則,發(fā)病部位往往十分復(fù)雜,因此對診治造成困難,難以量化分析,而且醫(yī)生也難提供個性化治療方案。但是基于深度學(xué)習(xí)的人工智能診斷,可以快速給出診斷意見,并且診斷率達(dá)78%,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于目前的臨床診斷準(zhǔn)確率。程國華強(qiáng)調(diào),未來,健培科技將會陸續(xù)對幾十種疾病進(jìn)行實驗分析。

  GPU耗能和數(shù)據(jù)流傳輸怎破?

  醫(yī)療影像大數(shù)據(jù)與一般的數(shù)據(jù)不同,一般的大數(shù)據(jù)是數(shù)據(jù)量大,但單個文件不大。而醫(yī)療影像大數(shù)據(jù)是單個文件超大。在進(jìn)行云計算時,GPU資源消耗特別大,而且耗能耗電會造成系統(tǒng)的不穩(wěn)定。云計算平臺是深度學(xué)習(xí)技術(shù)的基礎(chǔ)平臺,因此,解決GPU耗能問題將是對醫(yī)學(xué)影像進(jìn)行智能化分析的關(guān)鍵。

  在談到此問題時,程國華表示,繪圖運算在電影中的應(yīng)用已經(jīng)相當(dāng)成熟了,但是,我們平時看到的維妙維真的動畫,其實背后的GPU耗能很大。往往一部動畫電影做完至少需要三年的時間,如大型動畫電影《瘋狂動物城》,整整做了七年,才呈現(xiàn)出我們現(xiàn)在看到的震撼畫面。動畫不僅僅是呈現(xiàn)圖片那么簡單,它需要大量的渲染,因此其背后的運算量十分耗能耗時。如果海量的非結(jié)構(gòu)化影像數(shù)據(jù)全部采用GPU作為計算單元,醫(yī)院將需要支付巨額的服務(wù)器和電力使用費用,對機(jī)房的建設(shè)也有嚴(yán)格的要求,不利于產(chǎn)品的推廣、部署和使用。程國華解釋,健培科技自主研發(fā)的基于FPGA架構(gòu)的影像分析可以解決GPU運算性能功耗高的問題,F(xiàn)PGA架構(gòu)特點是在低功耗的情況下完成高強(qiáng)度的計算任務(wù),有助于深度學(xué)習(xí)技術(shù)真正的應(yīng)用于臨床實踐。

  另外,醫(yī)療影像數(shù)據(jù)有別于其他機(jī)器視覺應(yīng)用數(shù)據(jù)的一大特點是圖像的連續(xù)性,單張圖像不具備分析價值,只有連續(xù)的圖像序列才能對病照進(jìn)行完整分析,比如一個病照的CT影像常由多個切片構(gòu)成,只有通過三維重構(gòu)將所有的病照切片構(gòu)建成三維模型,計算機(jī)才能更好的進(jìn)行分析診斷。健培科技自主研發(fā)的三維圖像深度學(xué)習(xí)計算引擎在醫(yī)療行業(yè)屬于首創(chuàng),與傳統(tǒng)的圖像深度卷積網(wǎng)不同,三維的卷積網(wǎng)在網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)設(shè)計和并行計算方面都面臨巨大挑戰(zhàn),并且沒有現(xiàn)存的框架和庫可以使用,健培科技通過大量的實驗和探索,研制出了計算性能(訓(xùn)練和測試時間消耗)和精確度都得到醫(yī)院客戶認(rèn)可的深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),其中有五項獲得發(fā)明專利。

  政產(chǎn)學(xué)研用融合推動智慧醫(yī)療

  眾所周知,物聯(lián)網(wǎng)、移動互聯(lián)及深度學(xué)習(xí)技術(shù)的迅猛發(fā)展,給醫(yī)療產(chǎn)業(yè)帶來廣闊的發(fā)展契機(jī),但是,無論是醫(yī)療信息化的建設(shè)還是幫助醫(yī)療,必須以政產(chǎn)學(xué)研用相結(jié)合的模式共同推動,否則,任何一方孤軍奮戰(zhàn)都是一意孤行,無法真正的推動智慧醫(yī)療落地。

  程國華表示,在國家醫(yī)改政策的大背景下,政產(chǎn)學(xué)研用缺一不可,醫(yī)療大數(shù)據(jù)分析項目必須聯(lián)合當(dāng)?shù)卣⑿l(wèi)計委、研究院、企業(yè)、醫(yī)院主體等共同推動醫(yī)療產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。今年5月份,健培科技與哈爾濱南崗區(qū)簽訂項目戰(zhàn)略合作協(xié)議,健培科技投資7億落戶到哈爾濱南崗區(qū)的醫(yī)療大數(shù)據(jù)項目,是政產(chǎn)學(xué)研用相融合模式的典范。健培科技聯(lián)合哈爾濱市政府、衛(wèi)計委、哈醫(yī)大、三甲醫(yī)院的戰(zhàn)略合作,共同推動哈爾濱市醫(yī)療大數(shù)據(jù)互聯(lián)互通,使醫(yī)療資源整合共享,最大限度的發(fā)揮醫(yī)療大數(shù)據(jù)的價值和優(yōu)勢,盡快將最新技術(shù)成果用之于民。

  據(jù)了解,本醫(yī)療大數(shù)據(jù)中心項目主要致力于醫(yī)學(xué)影像大數(shù)據(jù)分析和存儲,建立人工智能診斷系統(tǒng),實現(xiàn)機(jī)器輔助醫(yī)生對疾病進(jìn)行診斷,主要是以幫助診療的方式來推動國內(nèi)智慧醫(yī)療建設(shè)。

  另外,運用深度學(xué)習(xí)技術(shù)的智能診斷,對影像質(zhì)量要求十分高,因此醫(yī)學(xué)影像必須嚴(yán)格符合一定的拍片標(biāo)準(zhǔn),才能更好進(jìn)行分析與智能運算,但是醫(yī)療影像質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)化沒有那么簡單,必須聯(lián)合政府、醫(yī)療、專家及協(xié)會共同研究與制定。據(jù)悉,健培科技正在積極聯(lián)合北京、上海大醫(yī)院以及解放軍第三零九醫(yī)院等其他幾家地方醫(yī)院來推動影像質(zhì)量與拍片標(biāo)準(zhǔn)化工作,過程雖然不易,真正落地或許也要3-5年時間,但這是未來的大趨勢。

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