據(jù)悉,捷鼎國際針對(duì)科學(xué)家、研究人員和工程師的高效能運(yùn)算 (HPC; High Performance Computing) 應(yīng)用,即將推出全新 NeoSapphire全 NVMe 快閃記憶體儲(chǔ)存陣列。NeoSapphire 全 NVMe 快閃記憶體儲(chǔ)存陣列的高性能、出色的數(shù)據(jù)吞吐量和低延遲特色使其成為高效運(yùn)算應(yīng)用的理想儲(chǔ)存解決方案,例如基因組學(xué)、化學(xué)工程運(yùn)算和工程模擬運(yùn)算。這款儲(chǔ)存解決方案已經(jīng)在亞大基因科技 (Atgenomix) 的企業(yè)級(jí)生物資訊分析 (Bioinformatics) 應(yīng)用中獲得驗(yàn)證,該解決方案提供一個(gè)可靠的基因定序數(shù)據(jù)平臺(tái),研究人員可以利用他們所需的任何工具快速且簡單的獲得基因組的分析結(jié)果。
由于基因組測(cè)序在分析時(shí)會(huì)產(chǎn)生巨量的數(shù)據(jù),亞大基因科技提供創(chuàng)新的分散式基因定序分析平臺(tái),將復(fù)雜的基因體研究檢測(cè)簡化為適合研究人員使用的運(yùn)算環(huán)境,為了加速標(biāo)準(zhǔn)分析流程,亞大基因科技採用 NeoSapphire 全閃存陣列來快速擴(kuò)充分析基因組模擬算法所需的儲(chǔ)存工作量。亞大基因科技利用 Apache Spark 作為基因組數(shù)據(jù)分析的叢集計(jì)算平臺(tái),這種高效運(yùn)算應(yīng)用程序需要高速網(wǎng)絡(luò)、高效能的儲(chǔ)存系統(tǒng)、大容量的記憶體與平行計(jì)算能力。一些高效叢集運(yùn)算框架使用雙 CPU設(shè)計(jì) 和內(nèi)部硬碟的伺服器,這種系統(tǒng)架構(gòu)雖能提供足夠的計(jì)算能力,但往往存在 I/O 存取瓶頸,并且會(huì)拖延整個(gè)最后計(jì)算結(jié)果的時(shí)間。藉由捷鼎國際的 NeoSapphire 儲(chǔ)存解決方案,亞大基因科技及其客戶能夠更快、更經(jīng)濟(jì)地縮短基因組數(shù)據(jù)分析所需要的計(jì)算時(shí)間。
為了解決科學(xué)研究與其他高效運(yùn)算應(yīng)用中的效能瓶頸,捷鼎國際的 FlexiRemap? 軟體技術(shù)把計(jì)算節(jié)點(diǎn)所產(chǎn)生的動(dòng)態(tài)資料平行寫入儲(chǔ)存系統(tǒng)這種方式根本性的消除 I/O 存取瓶頸,可快速滿足高效運(yùn)算在各種不同應(yīng)用領(lǐng)域的需求,亦不需要增加昂貴的計(jì)算節(jié)點(diǎn)設(shè)備。高效運(yùn)算應(yīng)用中大多數(shù)的 I/O 密集型需求,必須將整個(gè)模擬計(jì)算不斷與之前的演算檢查點(diǎn)進(jìn)行比較,而臨床實(shí)驗(yàn)中的基因組研究就是一個(gè)很好的案例。
亞大基因科技股份有限公司執(zhí)行長暨共同創(chuàng)辦人張明臺(tái)表示:「Atgenomix SeqsLab 的企業(yè)級(jí)叢集計(jì)算能夠在整個(gè)基因組和外顯子組的分析中提供多個(gè)數(shù)量級(jí)的加速性能,與捷鼎國際的 NeoSapphire 高效能平行儲(chǔ)存設(shè)備整合可大幅提高 3 倍數(shù)據(jù)處理的速度,這個(gè)卓越的結(jié)果可為我們的客戶提供一個(gè)完整、可靠且可擴(kuò)展的基因組資訊分析平臺(tái)?!?/p>
捷鼎國際美國總經(jīng)理余人仰表示:「儲(chǔ)存性能和 IT 基礎(chǔ)設(shè)施的表現(xiàn)已經(jīng)成為企業(yè)和研究組織在業(yè)務(wù)模式上的明顯競(jìng)爭優(yōu)勢(shì)。捷鼎國際希望在各行各業(yè)中提供創(chuàng)新的高效能運(yùn)算儲(chǔ)存解決方案。藉由捷鼎國際的 NeoSapphire 全快閃記憶體儲(chǔ)存陣列,企業(yè)和科學(xué)家將能夠快速提供研究結(jié)果,最大限度地處理數(shù)據(jù)量,并讓企業(yè)與科學(xué)家們獲得更多的業(yè)務(wù)機(jī)會(huì)與創(chuàng)新的科學(xué)發(fā)現(xiàn)。」